美科学家完成炭疽基因组测序

        据美国《发现》杂志最近报道，美国乔治亚理工学院科学家使用一种称为“RNA测序”的新技术，描绘出了炭疽芽孢杆菌的基因表达。这标志着可全面定义任何细菌转录，并为研究细菌如何调控基因表达提供了更多细节。
        乔治亚理工学院光电系统实验室的研究人员表示，细菌的基因组测序已是相当普通的事情，但要更深层次地定义其转录是一件非常艰巨的任务。使用传统方法，实际上一次只能确定一个基因，即使是研究最为广泛的物种，要对其进行完整意义上的转录也是遥不可及之事。RNA测序方法使科学家们得以克服传统方法的局限，以非常详细的方式观察B型炭疽基因组的5000多个基因中的每一个基因的表达和调控。
        RNA测序方法通过使用一种称为高通测序的技术来实施，可同时对数百万个信使RNA进行测序。虽然这种方法在2008年曾被用来定义一些真核有机体的转录，但其难以适用于细菌，因为细菌信使RNA具有不同的结构，且不易和细胞中的其他RNA相分离。
        为了解决这个问题，乔治亚理工学院和生命技术公司的研究人员开发了一套可让RNA测序适用于任何细菌的程序。
        在使用这种技术研究B型炭疽的过程中，研究人员对收集自不同条件下生长的B型炭疽细胞进行了测序。他们采集了超过2亿7千万个序列“标记”，其中每一个序列相当于一个RNA分子的短片段，然后，他们使用自己开发的定制软件工具将其拼接在一起。